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深入解析數字PCR系統的工作流程及優勢

發布時間:2023.04.03 16:56:26 信息來源: 閱讀次數:


  數字PCR是一種高靈敏度的核酸絕對定量分析技術,它繼實時熒光定量PCR之后,為科研和臨床領域提供了更為精確和可靠的核酸定量方法。數字PCR系統通過獨特的工作流程,實現了對核酸樣本的精確分區和擴增,從而能夠準確計算出核酸拷貝數,為基因突變檢測、拷貝數變異分析、病毒微生物檢測等領域提供了強大的技術支持。
  一、工作流程
  數字PCR系統的工作流程包括樣本制備、反應體系制備、分區或微滴生成、封蓋和熱循環、熒光信號檢測以及數據分析等步驟。
  1、樣本制備:
  這是數字PCR的第一步,涉及從生物樣本中提取DNA或RNA,或者使用已經制備好的核酸樣本。樣本的質量和純度對后續的實驗結果至關重要,因此,這一步需要嚴格遵循實驗操作規程,確保樣本的完整性和代表性。
  2、反應體系制備:
  根據數字PCR儀器和試劑的要求,制備包含引物、探針、dNTPs(脫氧核糖核苷酸三磷酸)、酶和緩沖液等的反應體系。這一步驟要求精確控制各組分的比例和濃度,以保證PCR反應的順利進行和擴增效率。
  3、分區或微滴生成:
  將制備好的反應體系分配到大量的微小分區或微滴中。這些分區或微滴是通過微流控技術、油包水乳化或其他方法生成的,每個分區或微滴都包含有反應所需的全部組分,且相互獨立。這一步驟是實現高精度和高靈敏度的基礎。
  4、封蓋和熱循環:
  將分區或微滴進行封蓋,以防止在熱循環過程中的液體蒸發和污染。隨后,進行PCR熱循環,使目標核酸在每個分區或微滴中進行擴增。熱循環過程中,通過精確控制溫度和時間,確保目標核酸的有效擴增。
  5、熒光信號檢測:
  在熱循環過程中,使用熒光染料或探針來監測目標核酸的擴增。當目標核酸被擴增時,熒光信號強度會相應增加。每個分區或微滴中的熒光信號強度與其中存在的目標核酸數量成正比,這為后續的定量分析提供了依據。
  6、數據分析:
  使用專門的軟件或分析方法,對每個分區或微滴的熒光信號進行分析。根據泊松分布和陽性比例,計算出核酸拷貝數,實現定量分析。這一步驟需要強大的數據處理能力和統計分析技能,以確保結果的準確性和可靠性。
  二、優勢
  1、高精度:
  數字PCR技術通過將反應體系分配到大量獨立的分區或微滴中,使得每個分區或微滴中的核酸拷貝數相對固定且可計數。這種方法避免了傳統PCR中由于模板濃度不均一而導致的誤差,從而實現了對核酸拷貝數的精確測量。因此,在基因表達、基因突變檢測等領域具有更高的精度和可靠性。
  2、高靈敏度:
  它能夠檢測到非常低濃度的核酸樣本,甚至能夠檢測到單個拷貝的核酸分子。這種高靈敏度使得數字PCR在病毒檢測、腫瘤標志物檢測等領域具有廣泛的應用前景。同時,還能夠通過優化反應體系和條件,進一步提高檢測靈敏度,滿足更多領域的需求。
  3、無需標準曲線:
  傳統PCR技術通常需要通過繪制標準曲線來進行定量分析,而數字PCR技術則無需這一步驟。因為數字PCR是根據每個分區或微滴中的熒光信號強度來計算核酸拷貝數的,因此無需依賴外部標準品進行校正。這一特點簡化了實驗操作流程,減少了實驗誤差,提高了實驗效率。
  4、多重檢測能力:
  可以在單個PCR反應中同時檢測多種核酸序列。這使其在復雜樣本的分析中更具優勢,能夠同時獲取多種目標核酸的信息,提高了實驗的效率和準確性。
  5、高耐受性:
  對抑制劑和污染物的耐受性較高,能夠在復雜的環境中進行穩定的PCR擴增。這使得數字PCR在實際應用中更具靈活性和適應性,能夠應對各種復雜的實驗條件。